MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 44494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	T	7	7	12	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005295	AT	3	6	20	25	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005295	A	6	6	28	33	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005295	ATTA	3	12	42	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005295	TAA	2	6	73	78	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005295	TAA	2	6	132	137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
7	NC_005295	AT	3	6	143	148	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
8	NC_005295	TA	3	6	160	165	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
9	NC_005295	ATG	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238732
10	NC_005295	ATA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
11	NC_005295	TAA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
12	NC_005295	AAG	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
13	NC_005295	A	7	7	439	445	100 %	0 %	0 %	0 %	57238732
14	NC_005295	GGA	2	6	466	471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238732
15	NC_005295	CTG	2	6	537	542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238732
16	NC_005295	ACA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
17	NC_005295	ATGA	2	8	584	591	50 %	25 %	25 %	0 %	57238732
18	NC_005295	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	57238732
19	NC_005295	AAC	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
20	NC_005295	ACA	2	6	660	665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
21	NC_005295	AAG	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
22	NC_005295	CAA	3	9	714	722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
23	NC_005295	AAT	2	6	748	753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
24	NC_005295	ACA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
25	NC_005295	TAA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
26	NC_005295	TAACA	2	10	907	916	60 %	20 %	0 %	20 %	57238732
27	NC_005295	A	6	6	920	925	100 %	0 %	0 %	0 %	57238732
28	NC_005295	AT	3	6	953	958	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
29	NC_005295	TAG	2	6	966	971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238732
30	NC_005295	GAA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
31	NC_005295	ATA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
32	NC_005295	AATG	2	8	1031	1038	50 %	25 %	25 %	0 %	57238732
33	NC_005295	TTA	2	6	1073	1078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238732
34	NC_005295	ATTA	2	8	1088	1095	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
35	NC_005295	A	6	6	1095	1100	100 %	0 %	0 %	0 %	57238732
36	NC_005295	ATT	2	6	1104	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005295	TA	3	6	1139	1144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005295	TAT	2	6	1199	1204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005295	TAA	2	6	1236	1241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005295	A	6	6	1240	1245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005295	TA	3	6	1247	1252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005295	TTA	2	6	1278	1283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005295	TAA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005295	TA	4	8	1329	1336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005295	ACA	2	6	1344	1349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_005295	AT	3	6	1386	1391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005295	TTTA	2	8	1394	1401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005295	TAA	3	9	1406	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005295	TAT	2	6	1433	1438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005295	TAAC	2	8	1483	1490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_005295	ATA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005295	TTA	2	6	1521	1526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005295	A	6	6	1540	1545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005295	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005295	TAA	2	6	1572	1577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005295	AT	3	6	1589	1594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005295	A	7	7	1595	1601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005295	TAC	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005295	AAT	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005295	A	7	7	1651	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005295	TAA	2	6	1687	1692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005295	CTA	2	6	1693	1698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005295	ATT	2	6	1713	1718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005295	TTAT	2	8	1737	1744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005295	AAC	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005295	ATC	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_005295	TA	4	8	1849	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005295	A	6	6	1870	1875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005295	AAT	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005295	TTA	2	6	1926	1931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005295	TAAT	2	8	2017	2024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005295	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005295	TAT	2	6	2068	2073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005295	TTA	2	6	2123	2128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005295	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005295	ATATC	2	10	2183	2192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_005295	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005295	ATA	2	6	2207	2212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005295	TA	3	6	2235	2240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005295	AT	3	6	2254	2259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005295	TAA	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005295	TAAA	2	8	2278	2285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005295	T	7	7	2293	2299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005295	ATT	2	6	2305	2310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005295	CCA	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_005295	A	6	6	2342	2347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005295	AT	4	8	2386	2393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005295	ATCT	2	8	2404	2411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_005295	AT	3	6	2418	2423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005295	TA	3	6	2438	2443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005295	CAA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_005295	ATA	2	6	2491	2496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005295	TTA	2	6	2510	2515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005295	ATT	2	6	2536	2541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005295	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005295	CTATA	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_005295	CTA	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005295	ATT	2	6	2588	2593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005295	ATC	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_005295	AATT	2	8	2615	2622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005295	TTC	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_005295	ATAAAT	2	12	2698	2709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005295	GAT	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238733
104	NC_005295	TTA	2	6	2820	2825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
105	NC_005295	CAAT	2	8	2856	2863	50 %	25 %	0 %	25 %	57238733
106	NC_005295	TCC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238733
107	NC_005295	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238733
108	NC_005295	TTA	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
109	NC_005295	A	6	6	2999	3004	100 %	0 %	0 %	0 %	57238733
110	NC_005295	TCA	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238733
111	NC_005295	AAAT	2	8	3062	3069	75 %	25 %	0 %	0 %	57238733
112	NC_005295	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	57238733
113	NC_005295	ACC	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57238733
114	NC_005295	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238733
115	NC_005295	ATTT	2	8	3131	3138	25 %	75 %	0 %	0 %	57238733
116	NC_005295	AT	3	6	3149	3154	50 %	50 %	0 %	0 %	57238733
117	NC_005295	T	7	7	3211	3217	0 %	100 %	0 %	0 %	57238733
118	NC_005295	ATT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
119	NC_005295	TAAC	2	8	3301	3308	50 %	25 %	0 %	25 %	57238733
120	NC_005295	CCAT	2	8	3330	3337	25 %	25 %	0 %	50 %	57238733
121	NC_005295	TAAT	2	8	3423	3430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005295	TA	3	6	3458	3463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005295	TA	3	6	3477	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005295	TGT	2	6	3484	3489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005295	TAG	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238734
126	NC_005295	A	9	9	3610	3618	100 %	0 %	0 %	0 %	57238734
127	NC_005295	ATAA	2	8	3632	3639	75 %	25 %	0 %	0 %	57238734
128	NC_005295	AAAT	2	8	3666	3673	75 %	25 %	0 %	0 %	57238734
129	NC_005295	TAA	2	6	3754	3759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238734
130	NC_005295	A	7	7	3808	3814	100 %	0 %	0 %	0 %	57238734
131	NC_005295	GAA	3	9	3896	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
132	NC_005295	TACA	2	8	3927	3934	50 %	25 %	0 %	25 %	57238734
133	NC_005295	AGA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
134	NC_005295	TTTCT	2	10	4024	4033	0 %	80 %	0 %	20 %	57238734
135	NC_005295	GAA	2	6	4040	4045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
136	NC_005295	A	6	6	4051	4056	100 %	0 %	0 %	0 %	57238734
137	NC_005295	AGA	3	9	4078	4086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
138	NC_005295	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238734
139	NC_005295	GTG	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238734
140	NC_005295	GCA	2	6	4202	4207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238734
141	NC_005295	GAT	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238734
142	NC_005295	TTA	2	6	4388	4393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005295	ACCTAT	2	12	4440	4451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_005295	TCA	2	6	4466	4471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_005295	ATA	2	6	4514	4519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005295	GAA	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005295	ACA	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_005295	TAA	2	6	4562	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005295	T	6	6	4573	4578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_005295	TAA	2	6	13316	13321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_005295	TTA	2	6	13323	13328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_005295	TCAT	2	8	13336	13343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
437	NC_005295	TAA	2	6	13370	13375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_005295	CAA	2	6	13380	13385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_005295	ATA	2	6	13404	13409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_005295	ATA	2	6	13444	13449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_005295	TTAA	2	8	13487	13494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_005295	ACTT	2	8	13503	13510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
443	NC_005295	AATATA	2	12	13537	13548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_005295	TA	5	10	13545	13554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_005295	ATAA	2	8	13570	13577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_005295	A	8	8	13576	13583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_005295	TTTA	2	8	13642	13649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_005295	TAA	2	6	13701	13706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_005295	ATTA	2	8	13727	13734	50 %	50 %	0 %	0 %	57238740
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452	NC_005295	T	6	6	13773	13778	0 %	100 %	0 %	0 %	57238740
453	NC_005295	ATC	2	6	13797	13802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238740
454	NC_005295	CTTT	2	8	13834	13841	0 %	75 %	0 %	25 %	57238740
455	NC_005295	T	6	6	13839	13844	0 %	100 %	0 %	0 %	57238740
456	NC_005295	CAT	2	6	13888	13893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238740
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463	NC_005295	AC	3	6	14047	14052	50 %	0 %	0 %	50 %	57238740
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469	NC_005295	A	7	7	14290	14296	100 %	0 %	0 %	0 %	57238740
470	NC_005295	CTA	2	6	14304	14309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_005295	TA	3	6	14308	14313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_005295	TCTAT	2	10	14400	14409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
473	NC_005295	TAC	2	6	14419	14424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_005295	ATT	2	6	14432	14437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_005295	TAA	2	6	14455	14460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_005295	CAA	2	6	14511	14516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_005295	ATTA	2	8	14536	14543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_005295	A	6	6	14568	14573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_005295	TAA	2	6	14575	14580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_005295	A	8	8	14584	14591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_005295	TA	3	6	14648	14653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_005295	TAA	2	6	14676	14681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238741
483	NC_005295	A	6	6	14680	14685	100 %	0 %	0 %	0 %	57238741
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496	NC_005295	AT	3	6	15222	15227	50 %	50 %	0 %	0 %	57238741
497	NC_005295	AAC	2	6	15231	15236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238741
498	NC_005295	ATG	2	6	15273	15278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238741
499	NC_005295	A	8	8	15336	15343	100 %	0 %	0 %	0 %	57238741
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